- Код статьи
- 10.31857/S0044460X23110082-1
- DOI
- 10.31857/S0044460X23110082
- Тип публикации
- Статья
- Статус публикации
- Опубликовано
- Авторы
- Том/ Выпуск
- Том 93 / Номер выпуска 11
- Страницы
- 1711-1721
- Аннотация
- Термическая обработка линейных дипептидов, находящихся в твердой фазе, позволяет получать их циклические аналоги с высоким выходом и без дополнительных затрат. Вместе с тем, такие реакции, протекающие в условиях ограничений кристаллической решетки с участием молекул, находящихся в цвиттер-ионной форме, изучены недостаточно. В настоящей работе изучена реакция циклизации дипептида L-лейцил-L-валин в кристаллической фазе при нагревании. С использованием подходов изоконверсионной кинетики определена кинетическая модель, описывающая этот процесс, рассчитаны кинетические параметры, включая энергию активации, множитель Аррениуса и порядок реакции. Оценена энантиомерная чистота образующегося циклического продукта. Изучена самосборка линейного и циклического дипептидов на твердой подложке. Результаты исследования будут полезны для установления механизма реакции циклизации дипептидов в твердой фазе, а также могут быть использованы при разработке эффективных и экономически выгодных способов получения циклических дипептидов.
- Ключевые слова
- твердофазная циклизация изоконверсионная кинетика лейцилвалин производные 2,5-дикетопиперазина самосборка атомно-силовая микроскопия
- Дата публикации
- 17.09.2025
- Год выхода
- 2025
- Всего подписок
- 0
- Всего просмотров
- 9
Библиография
- 1. Zhao K., Xing R., Yan X. // Peptide Sci. 2021. Vol. 113. Article ID e24202. doi 10.1002/pep2.24202
- 2. Antipin I.S., Alfimov M.V., Arslanov V.V., Burilov V.A., Vatsadze S.Z., Voloshin Ya.Z., Volcho K.P., Gorbatchuk V.V., Gorbunova Yu.G., Gromov S.P., Dudkin S.V., Zaitsev S.Yu., Zakharova L.Ya., Ziganshin M.A., Zolotukhina A.V., Kalinina M.A., Karakhanov E.A., Kashapov R.R., Koifman O.I., Konovalov A.I., Korenev V.S., Maksimov A.L., Mamardashvili N.Zh., Mamardashvili G.M., Martynov A.G., Mustafina A.R., Nugmanov R.I., Ovsyannikov A.S., Padnya P.L., Potapov A.S., Selektor S.L., Sokolov M.N., Solovieva S.E., Stoikov I.I., Stuzhin P.A., Suslov E.V., Ushakov E.N., Fedin V.P., Fedorenko S.V., Fedorova O.A., Fedorov Yu.V., Chvalun S.N., Tsivadze A.Yu., Shtykov S.N., Shurpik D.N., Shcherbina M.A., Yakimova L.S. // Russ. Chem. Rev. 2021. Vol. 90. N 8. P. 895. doi 10.1070/RCR5011
- 3. Manchineella S., Govindaraju T. // ChemPlusChem. 2017. Vol. 82. P. 88. doi 10.1002/cplu.201600450
- 4. Zhu X., Su H., Liu H., Sun B. // Anal. Chim. Acta. 2023. Vol. 1255. Article ID 341124. doi 10.1016/j.aca.2023.341124
- 5. Tao K., Xue B., Li Q., Hu W., Shimon L.J.W., Makam P., Si M., Yan X., Zhang M., Cao Y., Yang R., Li J., Gazit E. // Mater Today. 2019. Vol. 30. P. 10. doi 10.1016/j.mattod.2019.04.002
- 6. Wang Y.-M., Zeng Q., He L., Yin P., Sun Y., Hu W., Yang R. // iScience. 2021. Vol. 24. Article ID 102274. doi 10.1016/j.isci.2021.102274
- 7. Yang M., Yuan C., Shen G., Chang R., Xing R., Yan X. // J. Colloid Interface Sci. 2019. Vol. 557. P. 458. doi 10.1016/j.jcis.2019.09.049
- 8. Yang M., Xing R., Shen G., Yuan C., Yan X. // Colloids Surf. (A). 2019. Vol. 572. P. 259. doi 10.1016/j.colsurfa.2019.04.020
- 9. Chen Y., Tao K., Ji W., Makam P., Rencus-Lazar S., Gazit E. // Protein Peptide Lett. 2020. Vol. 27. P. 688. doi 10.2174/0929866527666200212123542
- 10. Tao K., Hu W., Xue B., Chovan D., Brown N., Shimon L.J.W., Maraba O., Cao Y., Tofail S.A.M., Thompson D., Li J., Yang R., Gazit E. // Adv. Mater. 2019. Vol. 31. P. 1807481. doi 10.1002/adma.201807481
- 11. Tao K., Fan Z., Sun L., Makam P., Tian Z., Ruegsegger M., Shaham-Niv S., Hansford D., Aizen R., Pan Z., Galster S., Ma J., Yuan F., Si M., Qu S., Zhang M., Gazit E., Li J. // Nat. Commun. 2018. Vol. 9. Article ID 3217. doi 10.1038/s41467-018-05568-9
- 12. Kleinsmann A.J., Nachtsheim B.J. // Org. Biomol. Chem. 2020. Vol. 18. P. 102. doi 10.1039/C9OB02198A
- 13. Santos D., Baptista R.M.F., Handa A., Almeida B., Rodrigues P.V., Torres A.R., Machado A., Belsley M., de Matos Gomes E. // Materials. 2023. Vol. 16. Article ID 2477. doi 10.3390/ma16062477
- 14. Safiullina A.S., Ziganshina S.A., Lyadov N.M., Klimovitskii A.E., Ziganshin M.A., Gorbatchuk V.V. // Soft Matter. 2019. Vol. 15. P. 3595. doi 10.1039/c9sm00465c.
- 15. Scarel M., Marchesan S. // Molecules. 2021. Vol. 26. Article ID 3376. doi 10.3390/molecules26113376.
- 16. Karanam G., Arumugam M. K. // Mol. Biol. Rep. 2020. Vol. 47. N 5. P. 3347. doi 10.1007/s11033-020-05407-5
- 17. Zhang H.-H., Yu W.-Y., Li L., Wu F., Chen Q., Yang Y., Yu C.-H. // J. Ethnopharmacol. 2018. Vol. 215. P. 156. doi 10.1016/j.jep.2018.01.005
- 18. Ye G., Huang C., Li J., Chen T., Tang J., Liu W., Long Y. // Mar. Drugs. 2021. Vol. 19. N 7. Article ID 402. doi 10.3390/md19070402.
- 19. Poonia B.K., Sidhu A., Sharma A.B. // J. Agr. Food Chem. 2022. Vol. 70. N 7. P. 2160. doi 10.1021/acs.jafc.1c07659
- 20. Winyakul C., Phutdhawong W., Tamdee P., Sirirak J., Taechowisan T., Phutdhawong W.S. // Molecules. 2022. Vol. 27. N 13. Article ID 4200. doi 10.3390/molecules27134200
- 21. Song Z., Hou Y., Yang Q., Li X., Wu S. // Mar. Drugs, 2021. Vol. 19. N 8. Article ID 403. doi 10.3390/md19080403
- 22. Kumar N., Mohandas C., Nambisan B., Kumar D.R.S., Lankalapalli R.S. // World J. Microbiol. Biotechnol. 2013. Vol. 29. P. 355. doi 10.1007/s11274-012-1189-9
- 23. Borthwick D. // Chem. Rev. 2012. Vol. 112. P. 3641. doi.org/10.1021/cr200398y
- 24. Kurbasic M., Semeraro S., Garcia A.M., Kralj S., Parisi E., Deganutti C., De Zorzi R., Marchesan S. // Synthesis. 2019. Vol. 51. P. 2839. doi 10.1055/s-0037-1612376
- 25. Basiuk V.A., Gromovoy T.Y., Chuiko A.A., Soloshonok V.A., Kukhar V.P. // Synthesis. 1992. Vol. 05. P. 449. doi 10.1055/s-1992-26131
- 26. Ziganshin M.A., Safiullina A.S., Gerasimov A.V., Ziganshina S.A., Klimovitskii A.E., Khayarov K.R., Gorbatchuk V.V. // J. Phys. Chem. (B). 2017. Vol. 121. P. 8603. doi 10.1021/acs.jpcb.7b06759
- 27. Smith J., Ali F.I., Soldatov D.V. // CrstEngComm. 2014. Vol. 16. P. 7196. doi 10.1039/c4ce00630e
- 28. Pérez-Mellor A., Le Barbu-Debus K., Zehnacker A. // Chirality. 2020. Vol. 32. P. 693. doi 10.1002/chir.23195
- 29. Ziganshin M.A., Gerasimov A.V., Ziganshina S.A., Gubina N.S., Abdullina G.R., Klimovitskii A.E. // J. Therm. Anal. Calorim. 2016. Vol. 125. P. 905. doi 10.1007/s10973-016-5458-y
- 30. Ziganshin M.A., Larionov R.A., Gerasimov A.V., Ziganshina S.A., Klimovitskii A.E., Khayarov K.R., Mukhametzyanov T.A., Gorbatchuk V.V. // J. Pept. Sci. 2019. Vol. 25. Article ID e3177. doi 10.1002/psc.3177
- 31. Safiullina A.S., Buzyurov A.V., Ziganshina S.A., Gerasimov A.V., Schick C., Gorbatchuk V.V., Ziganshin M.A. // Thermochim. Acta. 2020. Vol. 692. Article ID 178748. doi 10.1016/j.tca.2020.178748
- 32. Carlini L., Chiarinelli J., Mattioli G., Castrovilli M.C., Valentini V., De Stefanis A., Bauer E.M., Bolognesi P., Avaldi L. // J. Phys. Chem. (B). 2022. Vol. 126. N 16. P. 2968. doi 10.1021/acs.jpcb.1c10736
- 33. Ларионов Р.А., Ахметшин Ш.Р., Герасимов А.В., Морозова А.С., Зиганшина С.А., Хаяров Х.Р., Горбачук В.В., Зиганшин М.А. // ЖОpХ. 2022. Т. 58. Вып. 8. С. 787. doi 10.31857/S051474922208002X
- 34. Larionov R.A., Akhmetshin S.R., Gerasimov A.V., Morozova A.S., Ziganshina S.A., Khayarov K.R., Gorbatchuk V.V., Ziganshin M.A. // Russ. J. Org. Chem. 2022. Vol. 58. N 8. P. 1076. doi 10.1134/S1070428022080024
- 35. Do H.T., Chua Y.Z., Habicht J., Klinksiek M., Hallermann M., Zaitsau D., Schick C., Held C. // RSC Adv. 2019. Vol. 9. P. 32722. doi 10.1039/C9RA05730G
- 36. Görbitz C.H. // Chem. Eur. J. 2007. Vol. 13. P.1022. doi 10.1002/chem.200601427
- 37. Ziganshin M.A., Gerasimov A.V., Gorbatchuk V.V., Gubaidullin A.T. // J. Therm. Anal. Calorim. 2015. Vol. 119. P. 1811. doi 10.1007/s10973-014-4279-0
- 38. Perov I.A., Ziganshina S.A., Larionov R.A., Gerasimov A.V., Gorbatchuk V.V., Ziganshin M.A. // Thermochimica Acta. 2021. V.700. Article ID 178937. doi 10.1016/j.tca.2021.178937.
- 39. Ye F., Cai M.H., Chen B., Xiao W., Li X.W., Guo, Y.W. // Chem. Nat. Compd. Vol. 54. P. 821. doi 10.1007/s10600-018-2488-7
- 40. Bellamy L.J. The Infra-red Spectra of Complex Molecules. New York: Wiley, 1975. doi 10.1007/978-94-011-6017-9
- 41. Akhmetshin S.R., Larionov R.A., Klimovitskii A.E., Skvortsova P.V., Akhmadiyarov A.A., Ziganshina S.A., Gorbatchuk V.V., Ziganshin M.A. // J. Mol. Liq. 2023. Vol. 387. Article ID 122613. doi 10.1016/j.molliq.2023.122613
- 42. Vyazovkin S., Burnham A.K., Criado J.M., Pérez-Maqueda L.A., Popescu C., Sbirrazzuoli N. // Thermochim Acta. 2011. Vol. 520. P. 1. doi 10.1016/j.tca.2011.03.034
- 43. Vyazovkin S., Chrissafis K., Di Lorenzo M.R., Koga N., Pijolat M., Roduit B., Sbirrazzuoli N., Suñol J.J. // Thermochim Acta. 2014. Vol. 590. P. 1. doi 10.1016/j.tca.2014.05.036
- 44. Friedman H.L. // J. Polym. Sci. (A). 1964. Vol. 6. P. 183. doi 10.1002/polc.5070060121
- 45. Ozawa T. // Bull. Chem. Soc. Japan. 1965. Vol. 38. P.1881. doi 10.1246/bcsj.38.1881
- 46. Ozawa T. // Thermochim Acta. 1992. Vol. 203. P. 159. doi 10.1016/0040-6031(92)85192-X
- 47. Flynn J.H., Wall L.A. // J. Res. Natl. Bur. Stand. 1966. Vol. 70. P. 478. doi 10.6028/jres.070A.043
- 48. Logvinenko V.A., Dybtsev D.N., Bolotov V.A., Fedin V.P. // J. Therm. Anal. Calorim. 2015. Vol. 121. P. 491. doi 10.1007/s10973-015-4430-6